Достижения: Серебрянный призер чемпионата России 1995 г.,
бронзовый призер чемпионата России 1994 г., обладатель Кубка России 1996, 1997 г., участник отборочных матчей ЧМ-98.

Основным вратарем сборной России Овчинников стал после того, как национальную команду возглавил Борис Игнатьев. Вратарь "Локо" постепенно вытеснил из стартового состава опытнейшего Станислава Черчесова. Сергей защищал наши ворота в печально знаменитом благодаря предвзятому судейству чеха Крондла матче против болгар, а затем и в двух играх с Италией. Эти поединки славы Овчинникову славы не принесли, однако и камня в его огород никто не мог кинуть. Тот период оказался самым непростым в его карьере. В 1997 году он переходит в португальскую "Бенфику", где оказался в тени знаменитого бельгийца Мишеля Прюдомма. Сборная России не попадает на чемпионат мира, потеряв два важных очка в матче с Кипром, в котором ворота защищал Черчесов. В сборной сменился тренер и Овчинников, не имея постоянной игровой практики, оказался лишь третьим голкипером. Затем у руля сборной оказался Романцев, заменивший Бышовца. Он ставит Овчинникова на товарищеский матч с белорусами в Туле. а на одной из последних московских тренировок Сергей получает растяжение мышц бедра и в Париж даже не полетел. Уверенная игра Александра Филимонова на "Стад де Франс" заставила тренеров на год забыть об Овчинникове. В последний раз его пригласили в сборную в 2000 году на матч против второй команды Германии. Однако, в том матче весь матч отыграл Евгений Корнюхин. Босс (прозвище Сергея) обиделся на весь свет, заявив через своего агента, что он больше не собирается просиживать штаны на скамейке запасных в главной команде страны.

Агрессивность - одна из характерных черт Овчинникова. Однако можно вспомнить множество игроков экстра-класса с не меньшей агрессивностью, чем Сергей - Давидс, Эдмундо, Эфенберг, Чилаверт и другие. Овчинников часто позволяет себе резкие высказывания о тренере сборной России Олеге Романцеве.